Das FIFG gibt dem Bund die Möglichkeit, drei Arten von Institutionen ausserhalb der Hochschulen zu fördern: Forschungsinstitutionen, Forschungsinfrastrukturen und Technologiekompetenzzentren. Der SWIR berät den Bund durch Empfehlungen zu Neugesuchen, evaluiert alle vier Jahre die Mehrjahresplanungen der geförderten Institutionen und untersucht im Auftrag des Staatssekretariats für Bildung, Forschung und Innovation SBFI vertieft einzelne Einrichtungen dieser Art.